Ngay khi Bộ Giao thông Vận tải lên kế hoạch tổ chức lại hoạt động vận tải thì ngành đường sắt Việt Nam cũng xây dựng phương án mới, dự kiến chạy lại các tuyến tàu chở khách từ ngày 1/10 theo nhiều giai đoạn.
Giai đoạn 1 (tối đa 10 ngày kể từ ngày áp dụng kế hoạch này) sẽ khai thác các đôi tàu tối đa 50% công suất so với biểu đồ chạy tàu trước dịch và có giãn cách chỗ trên tàu (không áp dụng giãn cách đối với toa giường nằm). Giai đoạn 2 (10 ngày sau giai đoạn 1) khai thác tối đa 70% công suất biểu đồ chạy tàu và có giãn cách. Giai đoạn 3 (sau giai đoạn 2) khai thác tối đa 70% biểu đồ và không phải giãn cách. Giai đoạn 4 doanh nghiệp khai thác bình thường.
Ở phía Bắc, Công ty CP Vận tải Đường sắt Hà Nội cho biết, từ tháng 10, đơn vị dự kiến chạy lại hàng ngày các đôi tàu khách LP5/LP6 trên tuyến Hà Nội - Hải Phòng, NA1/NA2 tuyến Hà Nội - Vinh, SE19/SE20 tuyến Hà Nội - Đà Nẵng. Riêng tuyến Hà Nội - Hải Phòng dự kiến chạy thêm tàu dịp cuối tuần. Ở phía Nam, Công ty CP Vận tải Đường sắt Sài Gòn dự kiến chạy lại đôi tàu khách Thống Nhất SE8/SE7 giữa TP.HCM - Hà Nội.
Các doanh nghiệp vận tải đường sắt sẽ tiếp tục áp dụng chính sách giảm giá vé để thu hút hành khách, ví dụ như khách mua vé khứ hồi lượt về được giảm 7-10% giá vé cùng thời điểm tùy theo mác tàu, loại chỗ và ngày đi trong tuần. Người thuộc diện chính sách, khách đoàn cũng được giảm giá.
Mức giá tối thiểu của vé hành khách tại đoạn ngắn là 30.000 đồng. Các chỗ ngồi thuận lợi trên toa xe được tính cộng thêm theo cự ly: từ 300 km trở xuống tính thêm 10.000 đồng/vé; từ 301 km trở lên tính thêm 20.000 đồng/vé. Chỗ thuận lợi trên toa giường nằm với cự ly từ 300 km trở xuống tính thêm 20.000 đồng; từ 301-650 km tính thêm 30.000 đồng; từ 651 km trở lên tính thêm 35.000 đồng/vé.
Ngoài ra, ngành đường sắt tiếp tục tổ chức chạy tàu chuyên biệt vận chuyển người dân từ các tỉnh phía Nam trở về khi địa phương có nhu cầu.
